In der Aquaristik wird H2O2 gerne verwendet, um mittels eines Oxydators atomaren Sauerstoff in das Aquarium einzubringen.
Ferner wird es zur Bekämpfung von Algen und Hydren eingesetzt und zur Desinfektion von Aquarien und Technik.
Dabei sollte beachten werden, dass eine zu hohe Konzentration von H2O2 im Aquarium die Kiemen von Garnelen und Fischen angreifen kann.
Wasserstoffperoxid wirkt stark ätzend. Falls man Wasserstoffperoxid auf die Haut bekommt, sollte man die Stelle mit Wasser gut spülen (Verdünnung), oder zumindest sofort von der Haut entfernen. Es tötet die Hautzellen schnell ab, diese färben sich dann weiß.